学校现辖崂山、鱼山和浮山三个校区，设有20个院，1个基础教学中心，1个社会科学部，72个本科专业。现有8个博士后流动站，12个博士学位授 权一级学科， 63个博士学位授 权学科(专业)，34个硕士学位授 权一级学科点、179个硕士学位授 权学科(专业)，13个类别硕士专业学位授 权点，是批工程博士专业学位授 权点，还具有招收高校教师(15个专业领域)、职业学校教师攻读硕士学位资格。学校有2个一级学科重点学科、10个二级学科重点学科(含1个培育学科)、7个教育 部重点实验室、4个教育 部工程研究中心，1个农业部重点实验室，20个山东省重点学科、2个山东省重点实验室、9个山东省高校重点实验室、3个青岛市重点实验室。海洋药物工程技术研究中心、联合国教科文组织中国海洋生物工程中心、由教育 部和海洋局共建的中国海洋发展研究中心设在学校。还拥有2个基础科学研究和教学人才培养基地，1个生命科学与技术人才培养基地，2个教育 部学科创新引智基地，1个985工程哲学社会科学创新基地(985工程海洋发展人文社会科学研究基地)，1个教育 部人文社会科学重点研究基地，1个文化产业研究中心和4个山东省人文社会科学研究基地，2个山东省 十二五高等学校人文社会科学研究基地。学校拥有投资亿元，供教学、科研使用的3500吨级海上流动实验室东方红2号海洋综合调查船。

学校拥有一支结构相对合理、学科领域覆盖较全的师资队伍。现有教职工2700余人，其中专任教师1350余人，博士生导师354人，45岁以下教师占教师总数约80%，近90%的教师具有研究生学历，其中54%的教师具有博士学位，重点学科具有博士学位的教师比例达到 85%，教师中有一年以上在校外学习和研究经历的占教师总数的70%，师资队伍的年龄结构、学历结构和学缘结构得到进一步优化，名列部属高校前茅。有一批国内外知名、学者在校治学执教：现有中国科学院院士3人、中国工程院院士5人， 千人计划特聘教授3人， 长江学者15人， 青年千人计划特聘教授1人，山东省 泰山学者特聘教授13人， 筑峰人才工程、 绿卡人才工程、 繁荣人才工程岗位教授15人，级有突出贡献的中青年 9 人，973计划和重大科学研究计划项目席科学家6人，自然科学基金委创新研究群体1个，杰出青年基金获得者 13人，享受国务院政府特殊津贴105人，入选 百千万人才工程一二层次9人，入选教育 部创新团队2个，教育 部新(跨)世纪人才77人，中国青年科学家奖1人。中国当代作家王蒙担任顾问、教授、文学与新闻传播学院名誉院长，原海洋局局长王曙光受聘海大顾问、教授、海洋发展研究院院长，画家范曾担任人文社会科学研究院院长，6位诺贝尔奖获得者受聘为名誉教授，10位知名作家受聘为 驻校作家，还有500多位国内外、学者组成的 客座教授团以及来自十几个的40多位、学者组成的 海外教授团。