中华医药科学院南京新中医学研究院于1987年由针刀医学培训的开创者王晓智院长及针刀医学的奠基人朱汉章教授创办，已有33年历史。次向全国推广针刀疗法，为针刀医学的发源地，被称为针刀医学的“黄埔军校”，已直接或间接培养国内外、中西医各类医务人员学习针刀医学、中医外治、中西医特色诊疗技术人才50余万，给我国乃至世界中医发展带来勃勃生机。2007年在向全国推广的诸多医疗技术融汇基础上，王自平院长以中医思想为引领，构建新的医学体系即新中医诊疗体系，自此，拓创了“以道驭术”培训的新局面，开展新中医诊疗体系的研究和推广，南京新中医学研究院又被称为新中医诊疗体系的“摇篮”。新中医诊疗体系以复兴中医、济世救人为己任，办学效果卓著，在全国中医教育界享有较高的声誉。
2018年初，南京新中医学研究院和谷里街道达成引进“新中医项目”发展战略，建设总面积9.6平方公里的新中医康养谷，目前，以桂谷生态园为中心的新中医医、教、研及生态康养基地已投入使用。新中医康养谷位于南京市江宁区，地处南京都市圈半径30公里南部核心的西南部，距南京主城新街口仅22公里，是南京南部旅游、休闲产业重点发展的绿色走廊建设带。
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